El equipo directivo del IES Gonzalo de Berceo de Alfaro está formado por:
- Director: Juan Ramón Villodas Orte
- Secretaria: Ana Belén Beltrán Gaya
- Jefa de Estudios: María Marqués Gil
- Jefa de Estudios adjunta de Bachillerato: Cristina Gómez Martínez
- Jefe de Estudios adjunto de Formación Profesional: José Ángel Rubio Aranda
- Coordinador de calidad: Ramón García Almagro
